实验中心实行主任负责制，中心主任张俊红由学校任命。同时，为更好地协助中心主任规划管理实验室，任命刘民杰为中心常务副主任，以加强领导，提高中心管理水平和服务能力。

中心为院属公共实验中心，实行院、系两级管理。学院负责中心的规划建设和经费投入，机械工程系负责中心的日常运行和管理。中心主任全面负责中心发展建设规划的制定、教学改革、课程建设，统筹协调教学和日常工作。